一是完善我国的法律制度，统一法律解释。法律规定的不完善，司法解释和部门规章的不一致是引起管辖权冲突的重要原因，立法部门应当尽快完善刑诉法的有关内容，作出统一的立法解释。

二是健全案件移送制度。刑诉法仅对审判管辖的移送作了规定，且比较原则，缺乏可操作性。公检法各自按照本部门的解释和理解进行案件移送，实践中出现冲突不可避免。因此，完善移送制度也是解决管辖权冲突的一个重要方面。

三是各执法主体应努力从立法原意出发，统一思想认识，使法律得到真正的执行。同时，应进一步加强执法监督，严格办案制度，打击地方、部门保护主义以及人情案、关系案等违法乱纪行为，消除易引发管辖权冲突的土壤。