个人独资企业申报个人所得税的时候，可以采取查账征收、或者是核定征收的方式。

1、税务机关对个人独资企业个人所得税的征收方法有二种，一种是查账征收适用于会计核算比较齐全的，另一种是核定征收.具体采用哪种征收方法由主管税务机关确定.

2、采用查账征收方法的，以每一纳税年度的收入总额，减除成本、费用以及损失后的余额，为应纳税所得额，然后根据个人所得税确定的税率表中对应的税率计算应纳税款.

3、采用核定征收方法的.依据国家税务总局关于印发《企业所得税核定征收办法》(试行)的通知》规定，采用按企业销售收入乘上应税所得率来计算应纳税所得额，然后，根据个人所得税确定的税率表中对应的税率计算应纳税款。

一、个人独资企业征收率是多少？

个人独资企业征收率是3%，具体理由如下：

《中华人民共和国增值税暂行条例》

第十一条小规模纳税人发生应税销售行为，实行按照销售额和征收率计算应纳税额的简易办法，并不得抵扣进项税额。应纳税额计算公式：

应纳税额=销售额×征收率

小规模纳税人的标准由国务院财政、税务主管部门规定。

第十二条小规模纳税人增值税征收率为3%，国务院另有规定的除外。

二、个人独资企业的的个人所得税怎么缴纳？

1、个人独资企业的的个人所得税的税率为5%～35%

《关于个人独资企业和合伙企业投资者征收个人所得税的规定》

第四条个人独资企业和合伙企业每一纳税年度的收入总额减除成本、费用以及损失后的余额，作为投资者个人的生产经营所得，比照《个人所得税法》的“个体工商户的生产经营所得”应税项目，适用5%～35%的五级超额累进税率，计算征收个人所得税。

前款所称收入总额，是指企业从事生产经营以及与生产经营有关的活动所取得的各项收入，包括商品(产品)销售收入、营运收入、劳务服务收入、工程价款收入、财产出租或转让收入、利息收入、其他业务收入和营业外收入。

2、个人独资企业以投资者为纳税义务人

《关于个人独资企业和合伙企业投资者征收个人所得税的规定》第三条个人独资企业以投资者为纳税义务人，合伙企业以每一个合伙人为纳税义务人。

第五条个人独资企业的投资者以全部生产经营所得为应纳税所得额；合伙企业的投资者按照合伙企业的全部生产经营所得和合伙协议约定的分配比例确定应纳税所得额，合伙协议没有约定分配比例的，以全部生产经营所得和合伙人数量平均计算每个投资者的应纳税所得额。

前款所称生产经营所得，包括企业分配给投资者个人的所得和企业当年留存的所得(利润)。