对于违法所得没收的情形，由人民法院依法执行。另外，对于贪污贿赂犯罪、恐怖活动犯罪等重大犯罪案件，犯罪嫌疑人、被告人逃匿，在通缉一年后不能到案，或者犯罪嫌疑人、被告人死亡，依照刑法规定应当追缴其违法所得及其他涉案财产的，人民检察院可以向人民法院提出没收违法所得的申请。

没收非法所得超过追诉时效怎么办

追究刑事责任才有追诉时效的限制，而对于追缴违法犯罪所得是没有追诉时效限制的，只要是违法犯罪所得的，就会进行追缴。

相关法律规定

《中华人民共和国刑法》

第六十四条【犯罪物品的处理】犯罪分子违法所得的一切财物，应当予以追缴或者责令退赔；对被害人的合法财产，应当及时返还；违禁品和供犯罪所用的本人财物，应当予以没收。没收的财物和罚金，一律上缴国库，不得挪用和自行处理。

违法所得的认定

1、违法所得的获取手段具有违法性。违法所得是行为人通过法律禁止的手段获取的，正是这个根本特征将违法所得与行为人的个人合法财产区别开来。由于违法所得的获取渠道是非法的，因此即使行为人事实上占有了金钱或财物，也不能获得法律承认的所有权，这也是对违法所得进行追缴或退赔处理的法律基础。

2．违法所得具有经济价值。行为人通过各种违法手段获取违法所得的根本目的在于追求这些财物的经济价值，如金钱、有价证券、文物、房屋等等。正因其具有经济价值才为执法部门的认定提供了衡量标准。

3．违法所得具有多重性和复杂性。违法所得既包括行为人通过犯罪手段获取的财物，也包括司法机关认定犯罪嫌疑人无罪后，由特定机关处理的行为人非法所得的财物。另外，司法实践中违法所得并不总是单独存在，它常常与赃款赃物、供犯罪使用的本人财物以及违禁品等各种不同性质的财物混杂在一起，只有准确区分它们之间的关系，才能把握违法所得的范围。

4．违法所得只能由国家授权的特定机关通过一定程序才能认定。违法所得的认定直接关系到被害人财产权益的维护，涉及对违法行为人合法财产与非法财产的准确界定，关系到国家机关之间的分工与执法公正，因此，违法所得必须由特定机关通过一定的程序加以认定。这里的特定机关包括两类，一是行政执法机关依照有关行政法规，对行政相对人作出没收违法所得的行政处罚；二是司法机关对刑事案件中的违法所得依法作出的追缴或退赔的决定。

《中华人民共和国刑事诉讼法》第二百九十八条对于贪污贿赂犯罪、恐怖活动犯罪等重大犯罪案件，犯罪嫌疑人、被告人逃匿，在通缉一年后不能到案，或者犯罪嫌疑人、被告人死亡，依照刑法规定应当追缴其违法所得及其他涉案财产的，人民检察院可以向人民法院提出没收违法所得的申请。公安机关认为有前款规定情形的，应当写出没收违法所得意见书，移送人民检察院。没收违法所得的申请应当提供与犯罪事实、违法所得相关的证据材料，并列明财产的种类、数量、所在地及查封、扣押、冻结的情况。人民法院在必要的时候，可以查封、扣押、冻结申请没收的财产。