土地确权后有纠纷的解决方法：1、当事人双方在自愿，不损害他人利益的情况下，根据法律法规的相关规定，直接商量出解决纠纷的方法；2、可以申请由人民政府出面进行调解，做出行政裁决；3、提出行政复议或者向人民法院起诉。当事人对人民政府做出的裁决不服的，可根据《行政复议条例》和《行政诉讼法》的相关规定，可以在接到处理决定书之日起十五日内向作出处理决定的上级人民政府国土资源行政主管部门申请行政复议。

农村土地确权纠纷怎么解决

1、找双方进行协商解决，在因土地发生纠纷之后，双方可以在自愿互谅的基础原则上按照相关的规定，在不损害其他人的利益前提下进行协商，自行解决纠纷。

2、双方协商解决之后要签署相关的协议，双方自愿执行，面对没有法律的约束，要是双方中有一种后悔拒绝执行，那么另一方就可以申请向当地政府的土地管理部门进行调解。

3、政府进行调解，相关政府单位根据自己的情况和人员进行调节，如果对政府的处置不服的可以接到处置通知后的30个工作之内向法院提起诉讼，在争议解决之前，双方都不可以改变土地的现状。

农村地区的土地所有权属于集体，即使在完成确权手续之后，确权人也仅享有土地的使用权。若是此类土地被征收，那么征地补偿款属于集体组织。当然，被征土地上可能会存在附着物，若是依照约定需要对附着物进行赔偿，那么赔偿款需要支付给土地的使用人。

《中华人民共和国土地管理法》第十六条规定，土地所有权和使用权争议，由当事人协商解决；协商不成的，由人民政府处理。单位之间的争议，由县级以上人民政府处理；个人之间、个人与单位之间的争议，由乡级人民政府或者县级以上人民政府处理。当事人对有关人民政府的处理决定不服的，可以自接到处理决定通知之日起三十日内，向人民法院起诉。在土地所有权和使用权争议解决前，任何一方不得改变土地利用现状。