行政处罚立案时要把握：

一、主体明确。行政处罚一般案件立案程序主体明确是行政处罚的首要问题，必须把好主体关口。

1、行政处罚的主体明确。行使农业行政处罚的主体有两类，一是农业行政管理机关，二是法规授权的组织。县（区）以上农业行政管理部门是农业行政处罚的主体机关，市植物检疫站、市兽医卫生监督检验所按照法规授权，在法定职权范围内行使行政处罚权，并对实施行政处罚的后果承担法律责任。

2、申辩、复议、诉讼、的主体要明确。行政相对人认为行政处罚侵犯其合法权益，有依法提出听证、申请复议、提起诉讼、要求赔偿的权利。对农业行政管理机关实施行政处罚不服，有向作出处罚的上级机关提起行政复议，行政诉讼是人民法院对行政处罚进行司法审查，当事人双方法律地位是平等的。提起诉讼由最初作出行政处罚的农业行政机关所在地人民法院管辖，经过复议改变行政处罚行为，复议机关是被告；复议机关维持行政处罚决定，作出行政处罚的农业行政机关、法规授权的组织是被告，受委托组织作出的行政处罚，委托的行政机关是被告。

3、依法行使处罚权。执法主体行使农业行政处罚权必须注意两点：要有处罚权限，法无授权不得执行，法有授权必须执行；法律法规条款中有明确规定的，应依法归口负责。不能逾越法定权限，包括执法手段、处罚程度和处罚时间均不能越权；例如《种子法》第九章第五十五条“农业、林业行政主管部门是种子行政执法机关”，其他政府部门对种子实施行政处罚就超越了执法权限。

二、事实清楚。违法行为人的违法事实清楚，才能依法给予行政处罚。认定“事实清楚”必须把握同时具备的三个条件：

1、必须符合合法有效的农业法律法规所确定的法定事实。一是指证一个违法事实时，证据必须同时符合客观性、关联性、合法性要求，使每一个证据都是定案的证据，使认定的违法事实证据确凿。为此，要对案件情况进行全面、客观、公正的调查，认真收集书证、物证、视听资料、证人证言和当事人陈述、鉴定结论、勘验记录和现场笔录等证据，形成严密的证据链。二是行政机关作出行政处罚的文书也是证据，所以制作《行政立案审批表》、《案件处理意见书》、《违法行为处理通知书》、《行政处罚听证会通知书》、《行政处罚听证会报告书》、《行政处罚决定书》、《强制执行申请书》、《行政处罚结案报告》的时间要符合法定要求，内容顺序要合法，《行政处罚文书送达回证》必须有当事人或证明人签字等。