如果医疗机构不承认发生医疗事故，受害人一方可以向法院起诉，主张权利。患者因医疗事故受到人身或财产损失的，有权起诉医疗机构，要求医疗承担医疗损害赔偿责任。此类诉讼中，当事人可以申请医疗事故责任鉴定。通过鉴定确认医疗机构是否存在医疗过错。法院会综合在案证据，确定医疗机构是否需要承担医疗损害赔偿责任。

医疗事故赔偿申请怎么办？

医疗事故赔偿的申请流程为：1、若当事人协商处理的，流程为达成赔偿协议、指定协议书、履行赔偿义务等；2、若当事人调解处理的，流程为申请调解、制作调解协议、履行调解协议等；3、若当事人起诉处理的，流程为提交起诉状、法院依法裁判、履行生效裁判文书等。

《中华人民共和国民法典》第一千一百七十九条侵害他人造成人身损害的，应当赔偿医疗费、护理费、交通费、营养费、住院伙食补助费等为治疗和康复支出的合理费用，以及因误工减少的收入。造成残疾的，还应当赔偿辅助器具费和残疾赔偿金；造成死亡的，还应当赔偿丧葬费和死亡赔偿金。