依据专利实施许可合同备案办法的规定，独占许可的专利合同未备案的，可以起诉侵权人，但利益能不能得到保障要视具体情况而定。

相关法律规定

《专利实施许可合同备案办法》

第十九条经备案的专利实施许可合同的种类、期限、许可使用费计算方法或者数额等，可以作为管理专利工作的部门对侵权赔偿数额进行调解的参照。

第二十条当事人以专利申请实施许可合同申请备案的，参照本办法执行。

申请备案时，专利申请被驳回、撤回或者视为撤回的，不予备案。

第二十一条当事人以专利申请实施许可合同申请备案的，专利申请被批准授予专利权后，当事人应当及时将专利申请实施许可合同名称及有关条款作相应变更;专利申请被驳回、撤回或者视为撤回的，当事人应当及时办理备案注销手续。