运输合同纠纷管辖权确定是运输始发地、目的地或者被告住所地人民法院管辖，这点《民事诉讼法》第28条有明确的规定。运输合同纠纷处理方式有和解、协调、仲裁以及诉讼四种。

一、运输合同纠纷管辖权怎么确定

运输合同纠纷管辖权确定原则：

在铁路、公路、水上、航空运输和联合运输合同发生的纠纷，不同于一般的合同纠纷，即包括一方不履行合同发生的纠纷，如无故拖延运输期限，又包括在运输过程或者到达目的地时，托运的物品被损坏、丢失，或者对运输工具、设备造成损害，以及旅客人身遭受损害所发生的赔偿纠纷。因此，与《民事诉讼法》第24条和25条规定的合同纠纷。这类合同纠纷，可能发生在运输合同始发地、中转地、也可能发生在运输到达地。当事人因为上述运输合同发生纠纷，经过双方协商，可以自行解决，也可以向仲裁机构申请仲裁。如果提起诉讼，根据我国《民事诉讼法》第28条规定，因铁路、公路、水上、航空运输和联合运输合同纠纷提起的诉讼，由运输始发地、目的地或者被告住所地人民法院管辖。上述3个地方各人民法院对这类运输合同纠纷都有管辖权，当事人到任何一个法院起诉都可以。有管辖权的人民法院不得无故推托，应当依法受理。对两上以上有管辖权的人民法院，当事人只能选择其中一个法院起诉，由最先受理的人法院审理。

二、运输合同纠纷怎么处理

运输合同纠纷处理方式：

1．和解，即双方在针对争议部分进行沟通后相互理解达成共识。

2．协调，是指在有关部门的协调下，对争议部分予以明确，使争议双方能够解决争议问题。

3．仲裁，指对争议问题作出具有法律约束力的书面裁决，争议方可以根据合同约定或争议发生后达成的书面协议，提交仲裁机构对争议问题提请仲裁。

4．诉讼，这是对争议解决最终方式。争议方在合同中未约定仲裁条款，发生争议后又未达成书面仲裁协议的，可依法将争议提交人民法院受理，由人民法院依据司法程序通过调查、作出判决、采取强制措施等来处理纠纷。根据自身情况选取任意以上四种方式。

三、运输合同纠纷诉讼时效

运输合同纠纷诉讼时效是三年。诉讼时效期间自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。法律另有规定的，依照其规定。但是，自权利受到损害之日起超过二十年的，人民法院不予保护，有特殊情况的，人民法院可以根据权利人的申请决定延长。

《中华人民共和国民事诉讼法》（2021修正）：第一编 总则 第二章　管辖 第二节　地域管辖 第二十八条　因铁路、公路、水上、航空运输和联合运输合同纠纷提起的诉讼，由运输始发地、目的地或者被告住所地人民法院管辖。