公司章程对股份转让的限制之所以大多是依法进行的，是因为法律限制了公司章程对股份转让的限制空间，即原则上，除法律规定的限制外，公司章程对股份转让不再作限制。按照公司章程对股份转让进行限制，可以体现法律的灵活性，即法律不直接限制股份转让，而是赋予投资者选择是否按照公司章程限制股份转让的权利。因此，根据公司章程对股份转让的限制更符合私法自治的精神。根据《公司章程》，几乎所有对股权转让的限制都是以公司是否同意转让、董事会是否认可为依据的。为公司管理者尽可能维护股东的个人构成提供便利，以满足各类公司（包括股份有限公司）封闭经营的社会需要，股权转让的时效性直接影响到股权转让协议的效力，且大多采用相对无效理论。也就是说，违反公司章程的限制进行股权转让，或者按照公司章程的要求未经公司同意和认可进行股权转让，相对于公司不具有对抗性，但是相对于双方都具有对抗性，不能仅以违反公司章程的限制为由而主张无效。虽然我国法律没有按照公司章程对股份转让的限制作出规定，但在我国也有公司章程限制股份转让的情况，在这种情况下，首先，我们应该检查公司章程对股权转让的限制是否合法。例如，上市公司股权转让原则上不受任何限制；其次，即使公司章程规定的股权转让限制措施是合法的，股权转让协议的法律效力也不能因为自治权的限制而被否定