存在有效仲裁协议的发生建设工程施工合同纠纷能仲裁。当事人申请仲裁应当有仲裁协议；有具体的仲裁请求和事实、理由；属于仲裁委员会的受理范围。没有仲裁协议，一方申请仲裁的，仲裁委员会不予受理。

一、仲裁适用范围

仲裁的纠纷解决方式所适用的范围为：平等主体的公民、法人和其他组织之间发生的合同纠纷和其他财产权益纠纷，可以仲裁。法律规定，当事人采用仲裁方式解决纠纷，应当双方自愿，达成仲裁协议。没有仲裁协议，一方申请仲裁的，仲裁委员会不予受理。

二、合同仲裁开庭后多长时间出结果

需要1-3个月。仲裁程序有：1、申请和受理当事人申请仲裁，应当向仲裁委员会递交仲裁协议、仲裁申请书及副本。2、仲裁委员会收到仲裁申请书之日起五日内，认为符合受理条件的，应当受理，并通知当事人;认为不符合受理条件的，应当书面通知当事人不予受理，并说明理由。3、仲裁委员会受理仲裁申请后，应当在仲裁规则规定的期限内将仲裁规则和仲裁员名册送达申请人，并将仲裁申请书副本和仲裁规则、仲裁员名册送达被申请人。4、当事人达成仲裁协议，一方向人民法院起诉未声明有仲裁协议，人民法院受理后，另一方在首次开庭前提交仲裁协议的，人民法院应当驳回起诉，但仲裁协议无效的除外;另一方在首次开庭前未对人民法院受理该案提出异议的，视为放弃仲裁协议，人民法院应当继续审理。

三、侵权纠纷能否由仲裁机构进行仲裁？

能，但是双方应当达成仲裁协议。当事人采用仲裁方式解决纠纷，应当双方自愿，达成仲裁协议。没有仲裁协议，一方申请仲裁的，仲裁委员会不予受理。当事人申请仲裁应当符合下列条件：(一)有仲裁协议;(二)有具体的仲裁请求和事实、理由;(三)属于仲裁委员会的受理范围。