1、对鱼塘及设施的认定。征收鱼塘和养殖水面，必须是付出人工劳动的养殖方式及相应设施，而区别于自然水体或几位简单粗放的养殖方式。

2、对精养方式的认定。是否构成精养鱼塘，对其价值有很大影响。养殖方式分为精养、半精养和一般饲养几种程度，不易区别和把握，主观性较强。

3、由于鱼塘养殖属于特殊生产方式，采用收益还原法需要考虑的制约因素很多。最重要问题包括客观收益、收益年限、风险因素，还原率等。

一、对于征用鱼塘的补偿标准

按《土地管理法》的规定执行，可按照被征收土地的原用途经省、自治区、直辖市人民政府结合当地的具体情况制定相关补偿标准。《土地管理法》第四十七条征收土地的，按照被征收土地的原用途给予补偿。征收耕地的补偿费用包括土地补偿费、安置补助费以及地上附着物和青苗的补偿费。

1、征收耕地的土地补偿。为该耕地被征收前三年平均年产值的六至十倍。

2、征收耕地的安置补助费。按照需要安置的农业人口数计算。需要安置的农业人口数，按照被征收的耕地数量除以征地前被征收单位平均每人占有耕地的数量计算。每一个需要安置的农业人口的安置补助费标准，为该耕地被征收前三年平均年产值的四至六倍。但是，每公顷被征收耕地的安置补助费，最高不得超过被征收前三年平均年产值的十五倍。

3、征收其他土地的土地补偿费和安置补助费标准。由省、自治区、直辖市参照征收耕地的土地补偿费和安置补助费的标准规定。

4、被征收土地上的附着物和青苗的补偿标准。由省、自治区、直辖市规定。征收城市郊区的菜地，用地单位应当按照国家有关规定缴纳新菜地开发建设基金。依照本条第二款的规定支付土地补偿费和安置补助费，尚不能使需要安置的农民保持原有生活水平的，经省、自治区、直辖市人民政府批准，可以增加安置补助费。

5、国务院根据社会、经济发展水平，在特殊情况下，可以提高征收耕地的土地补偿费和安置补助费的标准。