结婚证没有了可以补办结婚证后再协议离婚。根据法律规定，申请办理离婚登记的当事人有一本结婚证丢失的，当事人应当书面声明遗失，婚姻登记员可以根据另一本结婚证受理离婚登记申请；申请办理离婚登记的当事人两本结婚证都丢失的，当事人应当书面声明结婚证遗失并提供加盖查档专用章的结婚登记档案复印件，婚姻登记员可根据当事人提供的材料受理离婚登记申请。

协议离婚程序

（一）双方当事人申请离婚登记

（二）双方当事人准备好相关证件和材料：

1、双方户口证明

2、双方居民身份证

3、所在单位、村（居）民委员会出具的介绍信

4、结婚证或者夫妻关系证明书

5、当事人一寸免冠近照各二张

6、离婚协议书

协议书应当写明双方当事人的离婚意思，表示子女抚养教育、夫妻一方生活困难的经济帮助、财产及债务等作出妥善安排的，协议内容应有利于保护妇女和未成年子女的合法权益。

（三）审查

婚姻登记机关对当事人离婚申请进行审查，对符合离婚条件的在一个月内发给离婚证，并注销结婚证，当事人取得离婚证，即解除夫妻关系。

《民法典》第一千零七十六条、第一千零七十七条和第一千零七十八条规定，离婚登记按如下程序办理：（二）受理。婚姻登记员按照《婚姻登记工作规范》有关规定对当事人提交的上述材料进行初审。申请办理离婚登记的当事人有一本结婚证丢失的，当事人应当书面声明遗失，婚姻登记员可以根据另一本结婚证受理离婚登记申请；申请办理离婚登记的当事人两本结婚证都丢失的，当事人应当书面声明结婚证遗失并提供加盖查档专用章的结婚登记档案复印件，婚姻登记员可根据当事人提供的上述材料受理离婚登记申请。

婚姻登记员对当事人提交的证件和证明材料初审无误后，发给《离婚登记申请受理回执单》。不符合离婚登记申请条件的，不予受理。当事人要求出具《不予受理离婚登记申请告知书》（附件3）的，应当出具。