一、检察院对退回二次补充侦查案件发现新线索怎么处理

1、人民检察院对已经退回监察机关二次补充调查或者退回公安机关二次补充侦查的案件，在审查起诉中又发现新的犯罪事实，应当将线索移送监察机关或者公安机关。对已经查清的犯罪事实，应当依法提起公诉。

2、法律依据：《人民检察院刑事诉讼规则》第三百四十九条

二、补充侦查需要什么条件

《人民检察院刑事诉讼规则》规定，法庭审理过程中遇有下列情形之一的，公诉人应当要求法庭延期审理：

1、发现事实不清、证据不足，或者遗漏罪行、遗漏同案犯罪嫌疑人，需要补充侦查或者补充提供证据的;

2、发现遗漏罪行或者遗漏同案犯罪嫌疑人，虽不需要补充侦查和补充提供证据，但需要提出追加或者变更起诉的;

3、需要通知开庭前未向人民法院提供名单的证人、鉴定人或者经人民法院通知而未到庭的证人出庭陈述的。