一、施工合同备案是施工单位办理还是建设单位办理？

施工合同备案是由建设单位办理的。

施工合同即建筑安装工程承包合同，是发包人和承包人为完成商定的建筑安装工程，明确相互权利、义务关系的合同。

建设工程施工合同实行备案制度。

建设部第89号令，即《房屋建筑和市政基础设施工程施工招标投标管理办法》第47条规定“订立书面合同7日内，中标人应当将合同送县级以上建设行政主管部门备案；在施工过程中，各级政府建设工程质量监督管理部门还要对工程建设的质量进行全面监督。

施工许可证由建设单位办理，但是办理施工许可证之前有许多手续要办。施工承包中标通知书和承包合同备案，监理中标通知书和监理合同备案，然后是质监、安监，最后是施工许可证。建设单位办理，施工单位和监理单位配合的。

二、建筑工程施工合同签订过程中应注意哪些问题？

1.合同主体应适格。对通过市场跟踪所选择的合同当事人，应核查其资质证书、企业资信、注册资本等工商登记信息，并核查其使用的印鉴是否合法与真实，及验明其是否具有主体资质、权利能力、行为能力。

2.合同内容应公平合法。合同文件内不得存在违反国家法律、行政法规的禁止性规定，否则将导致合同无效或者合同内部分相关条款的无效。

3.合同用辞应规范。合同用辞应表述准确，同样用辞的涵义应相互一致，不能存在互相矛盾、含糊不清、易产生误解或歧义的表述。

4.合同形式应与合同内容相符。

5.合理限制三方协议、债权转让协议在分包合同中的应用。建设工程的合同安排中常常存在由发包人选定指定分包人、由总承包人与指定分包人签订相关分包合同、并由发包人直接支付分包工程款给指定分包人的情况。

6.重视黑白合同。