涂改过的合同还是有效的。《中华人民共和国劳动法》第十八条规定：下列劳动合同无效：一违反法律、行政法规的劳动合同;二

采取欺诈、威胁等手段订立的劳动合同。无效的劳动合同，从订立的时候起，就没有法律约束力。确认劳动合同部分无效的，如果不影响其余部分的效力，其余部分仍然有效。劳动合同的无效，由劳动争议仲裁委员会或者人民法院确认。可见无效合同的范围比较小，涂改不是合同无效的原因。

通常情况下来说，任何合同或协议都不推荐涂改。何况现在已经是计算机时代，如果有修改的需要，重新制作一份，所花费的时间成本并不高。当然，如果有些不重要的条款小修改，为了节省人力和考虑环保，可以在所有份数上做同样的涂改后，压字盖章签字，表示认可。像劳动合同履行期限这种重要条款，尽量不作涂改为宜。

其焦点在于被涂改部分到底应该以涂改前为准还是涂改后为准，这是一个非常复杂的问题。因为司法实践上比较混乱，有的认为涂改部分双方之间都无法证明自己是正确的，索性归于无效，作事实劳动关系处理;有的认为由于企业没有给员工劳动合同，因此则采信劳动者的说法。前一种方法过于偏激，不利于促成合同有效的原则，笔者以为不适合采用。后一种认为方法则供参考。

在庭上交锋中，这个问题与谁主张谁举证将有着密切联系。跟单位签订了劳动合同之后，有些劳动者明显的发现自己的合同被单位给涂改了。一旦合同被单位给涂改了，很多劳动者就会特别的担心这份合同的内容会无效。

为了防止合同被涂改，最好的预防办法就是劳动合同一式两份，企业和员工各拿一份。《中华人民共和国劳动法》在制订时忽视了这个问题，一些地方法规则作了弥补，如《上海市劳动合同条例》第九条规定：劳动合同一式两份，当事人各执一份，此时也是为了保护劳动者的权益。

《中华人民共和国劳动法》（2018修正）：第三章　劳动合同和集体合同　　第十八条　下列劳动合同无效：\n　　（一）违反法律、行政法规的劳动合同；\n　　（二）采取欺诈、威胁等手段订立的劳动合同。\n无效的劳动合同，从订立的时候起，就没有法律约束力。确认劳动合同部分无效的，如果不影响其余部分的效力，其余部分仍然有效。\n劳动合同的无效，由劳动争议仲裁委员会或者人民法院确认。