以补充协议为准。因为补充协议可以视为合同双方主体对合同的变更协商一致了，不过这个新的约定一定要明确约定，不能模棱两可。补充协议中一般都会在尾部写明“原合同与本补充协议不一致的，以补充协议为准。”值得注意的是，原合同明示不得变更的条款，补充协议中对该条款发生的变更则不发生法律效力。

合同附加条款必须手写吗

合同补充条款手写有效，但是必须手写部分是合同签订时在双方见证的情况下填写后签字，手写部分在双方各自持有的合同文本上都有，且处于落款的上方，手写部分是对打印部分的修改、解释，但在手写部分的旁边有双方签字就有效。

《中华人民共和国民法典》第五百四十三条当事人协商一致，可以变更合同。