耕地建厂房的合法化方式是，个人可以因兴办乡镇企业申请用地用于建设厂房等建筑物，但所选地必须符合有关土地利用总体规划和当地城镇总体规划，拟建项目必须符合国家和当地产业政策。申请用地必须在国土部门办理农用地转用等建设用地审批手续，必须在规划部门办理选址、规划许可等审批手续，带项目申请用地还须到发改部门办理立项相关手续，到环保部门办理环评审批等相关手续。

农田建房怎样才合法

想在农田上建房子的话，是要去办理用地审批手续，只有当政府审批之后，才有权在农田上建造房子，如果手续没有办全之前就建造房子的话，是属于非法占地的。

《土地管理法》第8条规定，农村宅基地属于农民集体经济组织所有。该法第62条进一步规定，农村村民一户只能拥有一处宅基地，其宅基地的面积不得超过省、自治区、直辖市规定的标准。农村村民建住宅，应当符合乡（镇）土地利用总体规划，并尽量使用原有的宅基地和村内空闲地。

《土地管理法》

第三十一条

国家保护耕地，严格控制耕地转为非耕地。

国家实行占用耕地补偿制度。非农业建设经批准占用耕地的，按照“占多少，垦多少”的原则，由占用耕地的单位负责开垦与所占用耕地的数量和质量相当的耕地；没有条件开垦或者开垦的耕地不符合要求的，应当按照省、自治区、直辖市的规定缴纳耕地开垦费，专款用于开垦新的耕地。

省、自治区、直辖市人民政府应当制定开垦耕地计划，监督占用耕地的单位按照计划开垦耕地或者按照计划组织开垦耕地，并进行验收。

《土地管理法》第四十三条个人可以因兴办乡镇企业申请用地用于建设厂房等建筑物，但所选地必须符合有关土地利用总体规划和当地城镇总体规划，拟建项目必须符合国家和当地产业政策。