还在分期付款的房产是可以进行拍卖的。

首先，在明确该房产是属于被执行人个人所有的，且拥有相应的产权证明的情况下，按揭方式并不影响法院对该房产进行强制执行。

但因该房产属于通过按揭方式进行购买的，银行对房产是享有抵押权的。法院执行该房产，是要优先保障银行抵押权的实现的。

房产成功拍卖后获得的款项，首先要扣除拍卖和执行费用，然后就是银行的贷款，剩下的才可以就申请执行人的申请份额进行分配。

如果被执行人是唯一住房的话，还需考虑房屋拍卖后被执行人的生存问题，通常要遗留五年左右的房屋租金费用，最后才可以用来清偿债务。

且通常情况下，执行过程中银行也会提起案外人执行异议，所以可与银行先进行沟通，再申请强制执行。

所以，在申请拍卖之前，一定要了解清楚房屋价值多少钱，扣除上述情况的费用后会余下多少钱，不要最后费时费力却并没有很大的效益。