1、船舶经营租赁合同承租人租船的目的主要是经营船舶取得收益;而船舶程租合同的承租人租船的目的主要是完成一定的货物运输。

2、在船舶经营租赁下，承租人占有船舶;而程租下，船舶则由出租人占有。

3、在船舶经营租赁下，船用燃料、物料、给养等一般由承租人提供，承租人除交付租金外，还要承担船舶的全部航行费用;而在程租下，船用燃料、物料、给养等一般由出租人装备，承租人只支付租金。

4、在船舶经营租赁下，船长和船员一般由承租人雇用或租用;而在程租条件下，船长和船员均由出租人雇用。

5、船舶经营租赁的设定、转移和消灭，必须向船舶登记机关登记;而程租合同无须登记。