第一，银行并购是否影响货币政策的实施取决于它是否影响中央银行的货币供应市场或中央银行用来调节货币供应的市场。并购通过降低相关市场的竞争程度以及影响市场业绩来对这个市场产生影响。同时，银行并购也可能通过货币渠道、银行信贷和资产负债表渠道来改变连接央行决策和其他经济部门运行的货币政策传递机制。因此，银行并购可能影响政府的货币政策效果。

第二，银行并购对支付清算系统的影响，包括影响支付和清算过程的效率、支付系统的服务和风险等。机构和系统的合并导致的支付资金的高度集中达到一定的程度，其对运营问题的潜在影响也会出现。例如，如果一个支付银行不能有效处理支付命令，将产生严重的影响，这不仅对未能收到预期资金的单个市场参与者的流动性状况产生影响，也会对货币、资金和外汇市场等总体上产生影响。因此，银行需要完善的风险控制体制。

第三，银行并购将使中小企业的贷款减少，但是信息技术的发展可以有效地改变这一状况。例如网上银行等新的金融服务方式也增加了银行业务向社会、经济部门延伸的深度和广度，从而提高了中小企业和消费者获得金融服务的便利程度。美国网上银行的渗透率将由2000年的15%增长到2003年的33%，欧洲网上银行的增长率同期将从8%增长到22%。因此，银行业并购对中小企业贷款产生的负效应，可被技术变革和产品创新在一定程度上所抵消。

第四，银行并购对银行系统风险的影响，并购所产生的大的综合性金融机构将增加金融系统内的传染效应，使整个金融系统的风险控制和政府的监管受到挑战。因此，如何加强综合性金融机构的风险防范和监管，是金融整合后摆在银行和监管部门面前的一个现实问题。