1、借条协议公证费用收取后可能会退还，如果预收取的费用高于核定的公证费，则需要退还高出的部分。

相关法律规定：《公证程序规则》

第二十二条公证机构受理公证申请后，应当按照规定向当事人收取公证费。公证办结后，经核定的公证费与预收数额不一致的，应当办理退还或者补收手续。对符合法律援助条件的当事人，公证机构应当按照规定减收或者免收公证费。

2、因公证处的责任不能出具公证书或撤销公证书的，预收或已收的公证服务费应全部退还申请人

相关法律规定：《公证服务收费管理办法》

第八条公证处为申请人提供公证服务，依照规定的收费标准向申请人收取公证服务费，并向申请人出具收费票据。公证员个人不得私自收费。

第九条公证处向申请人收取公证服务费，可在受理公证事项时预收，也可以与申请人约定在承办公证事项期间分期收取。

第十条已受理的公证事项，申请人要求撤回的，按规定收取手续费。因公证处的责任不能出具公证书或撤销公证书的，预收或已收的公证服务费应全部退还申请人;因公证处和申请人双方责任而撤销公证书的，应按照责任的大小退还部分费用。因申请人提供伪证及举证不实而不能出具公证书的，预收的公证服务费不予退还。

一、遗嘱公证流程是什么？

1、申请与受理。

(1)申请。

《公证程序规则》第十五条规定：“公民、法人申请公证，应当向公证处提出，并填写公证申请表”。

第十六条规定：“公民、法人申请公证应当提交下列材料：

(一)身份证明，法人资格证明及其法定代表人的身份证明；

(二)代理人代为申请的，委托代理人须提交授权委托书，其他代理人须提交有代理权资格的证明；

(三)需公证的文书；

(四)与公证事项有关的财产所有权证明；

(五)与公证事项有关的其他材料”。

(2)受理。

《公证程序规则》第十七条规定：“符合下列条件的申请，公证处应予受理：

(一)申请人与申请公证的事项有利害关系；

(二)申请公证事项的当事人、利害关系人之间对申请公证的事项无争议；

(三)申请公证的事项属于公证处的业务范围；

(四)申请公证的事项属于本公证处管辖”。

公证处受理后，要在公证登记簿上登记；公证事项的承办人应制作受理通知单发给当事人，收取公证费，并开始建立公证卷宗。

公证处还可以应当事人的请求，帮助当事人起草、修改、拟定法律文书。

2、审查。

公证审查是公证活动中最重要的阶段，是确保公证质量的关键环节。

3、出具公证书。