妨害公务罪可以撤案，但只能由司法机关或者公安机关决定撤案，公民不能申请撤案。

如果存在以下情形之一的，相关机关会决定撤案：

（一）情节显着轻微、危害不大，不认为是犯罪的；

（二）犯罪已过追诉时效期限的；

（三）经特赦令免除刑罚的；

（四）依照刑法告诉才处理的犯罪，没有告诉或者撤回告诉的；

（五）犯罪嫌疑人、被告人死亡的；

（六）其他法律规定免予追究刑事责任的。

妨害公务罪属于哪个部门管辖的刑事案件

妨碍公务罪是指行为人故意妨碍国家机关工作人员执行公务，由治安部门管辖。妨碍公务罪如果情节轻微，则不构成犯罪，一般处警告或者最高二百元的罚款或者最低五日，最高十日的拘留并处最高500元罚款；如果构成了犯罪，则需要承担一定的刑事责任，一般处最高三年的有期徒刑、拘役、管制或者罚金。

《刑事诉讼法》第十六条，有下列情形之一的，不追究刑事责任，已经追究的，应当撤销案件，或者不起诉，或者终止审理，或者宣告无罪：

（一）情节显着轻微、危害不大，不认为是犯罪的；

（二）犯罪已过追诉时效期限的；

（三）经特赦令免除刑罚的；

（四）依照刑法告诉才处理的犯罪，没有告诉或者撤回告诉的；

（五）犯罪嫌疑人、被告人死亡的；

（六）其他法律规定免予追究刑事责任的。