公积金代扣的流程是这样的：

首先在还款卡里存入一个月的还款，作为启动资金。到还款日，银行把这部分还款划走，然后受您的委托从您的公积金帐户中提取出一个月的月还款，转入还款卡中。下个月再扣就扣这部分从您公积金帐户中转出来的钱，如此往复。如果您的公积金账户中的余额不足一个月的还款额，需要您往还款卡中补足差额，即200元。

一、主贷人及客户公积金停缴算违约吗

已停缴主贷人公积金，但另一方仍在缴公积金的没有罚息。合同一方作为主贷人，另一方作为副贷人，每个月到期后自主贷款人银行卡扣款，不足的部分自副贷款人银行卡扣款，双方均未按照合同约定还款，对于逾期的贷款计收罚息。

二、公积金里有钱为何扣银行卡钱

公积金里有钱却扣银行卡里面的资金原因如下：

1、由于个人公积金账户里面的余额不足，不足以完全抵扣该次房贷扣款，因此系统就会自动选择从银行卡进行扣款；

2、是用户公积金账户的资金没有转入到还款账户中去，导致无法扣款。

公积金贷款还款方式有两种，由借款人自行选择：

1、每月1-20日到贷款银行用现金偿还贷款本息；

2、委托贷款银行代扣偿还。