一、侵权纠纷土地承包经营权怎么处理

侵犯土地承包经营权纠纷双方当事人可以通过协商解决；协商不能达成一致的当事人可以通过调解解决纠纷；当事人不愿协商、调解或者协商、调解不成的可以向农村土地承包仲裁机构申请仲裁；对仲裁结果不服的可以直接向人民法院提起诉讼。

《中华人民共和国农村土地承包法》第五十五条

因土地承包经营发生纠纷的，双方当事人可以通过协商解决，也可以请求村民委员会、乡（镇）人民政府等调解解决。

当事人不愿协商、调解或者协商、调解不成的，可以向农村土地承包仲裁机构申请仲裁，也可以直接向人民法院起诉。

二、侵权纠纷土地承包经营权诉讼时效

侵犯土地承包经营权的，如果提起民事诉讼的，诉讼时效为3年，如果是提起行政诉讼的，诉讼时效一般是6个月，从知道权利被侵犯时开始计算。

《中华人民共和国行政诉讼法》第四十五条

公民、法人或者其他组织不服复议决定的，可以在收到复议决定书之日起十五日内向人民法院提起诉讼。复议机关逾期不作决定的，申请人可以在复议期满之日起十五日内向人民法院提起诉讼。法律另有规定的除外。

第四十六条

公民、法人或者其他组织直接向人民法院提起诉讼的，应当自知道或者应当知道作出行政行为之日起六个月内提出。法律另有规定的除外。

因不动产提起诉讼的案件自行政行为作出之日起超过二十年，其他案件自行政行为作出之日起超过五年提起诉讼的，人民法院不予受理。

《中华人民共和国民法典》

第一百八十八条向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。法律另有规定的，依照其规定。

诉讼时效期间自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。法律另有规定的，依照其规定。但是自权利受到损害之日起超过二十年的，人民法院不予保护；有特殊情况的，人民法院可以根据权利人的申请决定延长。

三、侵权纠纷土地承包经营权的起诉流程

具体起诉流程如下：

1．准备好起诉状，起诉状包括原告、被告的身份信息被告的身份信息以及诉求；

2．将起诉状递交到被告所在地法院；

3．法院受理后，同时需要缴纳诉讼费用；

4．法院会向被告送达起诉状副本、开庭通知书等；

5．等待开庭审理即可。

《中华人民共和国民法典》：第九章　诉讼时效　　第一百八十八条　向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。法律另有规定的，依照其规定。\n　　诉讼时效期间自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。法律另有规定的，依照其规定。但是，自权利受到损害之日起超过二十年的，人民法院不予保护，有特殊情况的，人民法院可以根据权利人的申请决定延长。