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一、企业自我评价及申请企业进行自我评价，认为符合认定条件的，企业可向认定机构提出认定申请。二、提交申请材料1、高新技术企业认定申请书；2、企业营业副本、税务登记证（复印件）；3、证书（独占许可合同）、生产批文，新产品或新技术证明（查新）材料、产品质量检验报告、省级以上科技计划立项证明，以及其他相关证明材料；4、企业职工人数、学历结构以及研发人员占企业职工的比例说明；5、经具有资质的中介机构鉴证的企业近三个会计年度研究开发费用情况表（实际年限不足三年的按实际经营年限），并附研究开发活动说明材料；6、经具有资质的中介机构鉴证的企业近三个会计年度的财务报表（含资产负债表、损益表、现金流量表，实际年限不足三年的按实际经营年限）以及技术性收入的情况表。三、合规性审查认定机构应建立高新技术企业认定评审专家库；依据企业的申请材料，抽取专家库内专家对申报企业进行审查，提出认定意见。四、认定、公示与备案认定机构对企业进行认定。经认定的高新技术企业在“高新技术企业认定管理工作网”上公示15个工作日，没有异议的，报送领导小组办公室备案，在“高新技术企业认定管理工作网”上公告认定结果，并向企业颁发统一印制的“高新技术企业证书”。
高新技术企业认定每年进行三次集中申报和审批，申报时间为3月、6月、9月的第一个工作日至第十个工作日。审批期限为45个工作日。高新技术企业的申请和认定按照以下程序进行：（一）企业网上填写《深圳市高新技术企业认定申请书》。（二）市民中心办公窗口初审通过后，市科技主管部门和市财政主管部门委托深圳市科技专家委员会组织专家对申报企业进行评审，提出认定意见。（三）市科技主管部门和市财政主管部门应当对通过审查的企业进行审查，审查通过的企业名单应当在线公示，公示期为5个工作日。对公示有异议的，组织相关机构调查后给出相应结论。审批通过后，由市科技主管部门和市财政部门颁发《深圳市高新技术企业认定证书》。
高新技术企业是知识密集、技术密集的经济实体。外高新技术企业必须具备下列各项条件：（一）从事本办法第四条规定范围内的一种或多种高新技术及其产品的研究、开发、生产和经营业务。（二）产权明晰，实行独立核算，自主经营，自负盈亏。（三）已有二年以上的营运期，运行机制良好。（四）具有大专以上学历的科技人员占企业职工总数的30％以上，从事高新技术产品研究、开发的科技人员应占企业职工总数的10％以上。从事高新技术产品生产或服务的劳动密集型高新技术企业，具有大专以上学历的科研人员占企业职工总数的20％以上。（五）年总收入在3000万元以上，全员劳动生产率在15万元／人．年以上，年人均利税在3万元以上，并有与其规模相适应的生产、经营场所和设施。技术性收入占本企业当年总收入50％以上的开发型高新技术企业，年总收入可限定在1000万元以上。（六）用于高新技术及其产品研究、开发的经费应占本企业每年总收入的4％以上。（七）企业的技术性收入与高新技术产品产值的总和应占本企业当年总收入的70％以上。（八）有明确的企业章程和严格的技术、财务管理制度。（九）企业的注册经营期在十年以上。
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