农村宅基地上的房屋所有权公证，应该遵从以下流程和步骤： 1、提交公证申请。当事人向有管辖权的公证处提出申请，填写申请表，并提交宅基地证书和房屋权属证书、个人身份证件及其他相关材料。 2、公证事项的受理。公证处对当事人的公证申请，经审查符合公证条件的，予以受理。 3、缴纳公证费用。按照公证处提供的收费标准，缴纳公证费用。 4、公证事项的审查。公证员在受理公证的同时，必须对当事人提交的材料进行审查，发现不完备或有疑义的，应通知当事人作必要的补充，公证处也有权对交易双方进行调查。 5、出具公证书。公证处经审查认为符合公证条件的，应当出具公证书。公证书按司法部门规定或批准的格式制作，自签署之日起生效。公证行为会产生证据上的效力，经公证的事项，可以直接作为证据使用。
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确定农村宅基地权归属方法是去乡镇一级的政府要求确权，由乡镇政府对双方争议的土地的使用权进行确切认定；土地权属要经过土地登记申请、地籍调查、核属审核、登记注册、颁发土地证书等土地登记程序，才能得到最后的确认和确定。
宅基地无法办理确权证书将会更房屋带来很多未知的风险，所以拥有宅基地的农民一定要确认自己的宅基地是否可以办理确权证书。下列几种情况未确权的宅基地将无法确权：1.宅基地权属不清。这主要说一块地有好几个主人，比如两三个兄弟共同拥有一个宅基地的情况，这就很难区分，也无法确定到底属于谁，确权证的名字写谁的，容易引起纠纷。2.一户的第二块宅基地是无法进行确权的。因为保持着一户一宅的原则，切实保证公平公正，不能够滥用别人宅基地，让别人没有得到政策的普惠，影响到整个地区确权工作的进行。3.除了上述的两个外，那些宅基地获得批准后闲置了两年以上的，以及地上的房屋是违建情况，不符合城乡规划建设的宅基地，也无法顺利进行确权。
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