1、个人工伤赔偿得的钱公司要扣除工伤时所花的医药费，如果工伤赔偿中，包括用人单位支付的医疗费用的话，用人单位扣除是合理的，如果不包括用人单位垫付的医疗费用的，用人单位不得扣除的。 2、《社会保险法》第三十八条因工伤发生的下列费用，按照国家规定从工伤保险基金中支付： （一）治疗工伤的医疗费用和康复费用； （二）住院伙食补助费； （三）到统筹地区以外就医的交通食宿费； （四）安装配置伤残辅助器具所需费用； （五）生活不能自理的，经劳动能力鉴定委员会确认的生活护理费； （六）一次性伤残补助金和一至四级伤残职工按月领取的伤残津贴； （七）终止或者解除劳动合同时，应当享受的一次性医疗补助金； （八）因工死亡的，其遗属领取的丧葬补助金、供养亲属抚恤金和因工死亡补助金； （九）劳动能力鉴定费。 第三十九条因工伤发生的下列费用，按照国家规定由用人单位支付： （一）治疗工伤期间的工资福利； （二）五级、六级伤残职工按月领取的伤残津贴； （三）终止或者解除劳动合同时，应当享受的一次性伤残就业补助金。
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工伤险对医药费的赔偿办法：职工在被认定为工伤后，对于符合工伤保险诊疗项目目录、工伤保险药品目录、工伤保险住院服务标准的医疗费，由社保经办机构从工伤保险基金中支付。
工伤赔偿金的计算公式为：医疗费用赔偿额=诊疗费+药品费+住院服务费。住院伙食补助金额=出差伙食补助标准（元/人/天）*70%*人数*天数；交通费和住宿费的报销=交通费+住宿费+伙食费；辅助设备费用补偿金额=常用适用器具的合理费用*器具数量。
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