发放工资的当月，计算应交个人所得税。如果当月发放多次，应该合并计税，也就是第二次、第三次、第四次与前面首先合并计税，然后补差。个税不是计提的时候产生的，是发放的时候计算的。因此即便计提的时候没有考虑到多次发放产生的税费，次月也必须按照税法申报。税法是不管你是否按月发放工资的，税法只关注每月发放的合计数是否符合申报纳税数。
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补发工资计算个人所得税的话，目前的普遍做法是允许还原至所属月份计算缴纳个人所得税，计算公式为：所属月份补发工资应纳税额={[（所属月份补发工资+原所属月份的工资薪金所得）—费用减除额]×适用税率-速算扣除数}—原所属月份已缴纳的个人所得税。
工资个税应该根据员工个人每月所得数额分别按照适用的税率进行计算，纳税人取得应税所得没有扣缴义务人的，应当在取得所得的次月十五日内向税务机关报送纳税申报表，并缴纳税款。
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