凡列入软科学研究计划的项目，其所取得的成果，均应按此方式组织鉴定。执行国家软科学研究计划项目所取得的成果，一般由国家科委负责组织鉴定。执行国务院各部门、各级地方科委软科学研究计划的项目，所取得的成果一般由国务院各部门、各级地方科委软科学研究管理部门负责组织鉴定，其中如取得了对促进国民经济发展及对国家、部门和地区的决策具有重大作用的软科学研究成果，国务院各部门和地方科委软科学研究管理部门也可申请由国家科委负责组织鉴定。凡需通过国家科委上报中央和国务院的重大软科学研究成果，必须经国家科委组织论证和鉴定后，方可上报。
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委托鉴定，应根据被鉴定题目的性质和难度，选择相应的鉴定机构。 事故调查所需的鉴定，一般指派或委托公安机关的鉴定职员、鉴定机构进行。 公安机关无法完成的，也可以委托公安机关制定的社会有资格的鉴定机构进行。 对当事人的精神病医学鉴定、对当事人的伤残评定、对有争议的财产损失评估。 应当委托具备资格的检修、鉴定、评估机构进行。 该机构可以是公安机关的鉴定机构，也可以是社会的鉴定机构，但均必需具备资格。
诉讼程序中司法鉴定机构的选择如下：自行鉴定没有争议的情况下，可以作为医疗纠纷处理的依据，行政鉴定是行政机关处理医疗纠纷的依据， 如果没有争议，经法院审查合法，也可以作为诉讼案件定案依据。 司法鉴定除具有一般鉴定的属性外还具有司法权威性，在对鉴定结论存在争议的情况下，司法鉴定作为司法活动往往行使最终决定权； 司法鉴定通常还作为法官认证的工具，实践中通常以司法鉴定结论作为裁判的依据。
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