轻伤案件已经在派出所调解的，检察院仍可以起诉。 根据《刑事诉讼法》的规定，对于轻伤案件，可以由公安机关组织双方当事人进行和解，达成和解协议并取得被害人谅解的，可以由法院予以从宽处理；对于犯罪情节轻微，不需要判处刑罚的，检察院也可以作出不起诉的决定。 所以，轻伤案件在公安机关达成和解协议后，检察院根据案件具体情况，仍是可以向法院提起公诉的。 《刑事诉讼法》 第二百七十七条下列公诉案件，犯罪嫌疑人、被告人真诚悔罪，通过向被害人赔偿损失、赔礼道歉等方式获得被害人谅解，被害人自愿和解的，双方当事人可以和解： (一)因民间纠纷引起，涉嫌刑法分则第四章、第五章规定的犯罪案件，可能判处三年有期徒刑以下刑罚的； (二)除渎职犯罪以外的可能判处七年有期徒刑以下刑罚的过失犯罪案件。 犯罪嫌疑人、被告人在五年以内曾经故意犯罪的，不适用本章规定的程序。 第二百七十八条双方当事人和解的，公安机关、人民检察院、人民法院应当听取当事人和其他有关人员的意见，对和解的自愿性、合法性进行审查，并主持制作和解协议书。 第二百七十九条对于达成和解协议的案件，公安机关可以向人民检察院提出从宽处理的建议。人民检察院可以向人民法院提出从宽处罚的建议；对于犯罪情节轻微，不需要判处刑罚的，可以作出不起诉的决定。人民法院可以依法对被告人从宽处罚。
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案子的始和终最后都需要检察院来把关和决定的。公安机关只是根据决定来执行而已。公安局把案件移交检查院，说明侦查结束——侦查终结，但也不排除退回补充侦查的可能。
一、侦查案件的范围不同。检察机关侦查的案件范围，是检察机关直接受理立案侦查的刑事案件，主要包括贪污贿赂犯罪案件，国家工作人员的渎职犯罪案件，国家机关工作人员利用职权实施的侵犯公民人身权利、民主权利的犯罪案件等。而公安机关侦查的案件范围，是除了人民检察院、国家安全机关、军队保卫部门、监狱负责侦查的刑事案件和人民法院直接受理的不需要侦查的轻微刑事案件以外的所有刑事案件。 二、所侦查案件的特点不同。检察机关侦查的案件侵害的大多是国家、社会的利益，除侵犯公民人身权利、民主权利等犯罪外，一般没有具体的被害自然人；这类犯罪行为与权力相结合，手段隐蔽，因而犯罪行为与犯罪结果一般不会自行暴露。公安机关侦查的案件，一般有具体的被害人，会留下较明显的犯罪现场和痕迹，犯罪较容易被发现。 三、侦查的程式往往不同。由上述犯罪特点决定，检察机关侦查的案件，一般开始就有明确的犯罪嫌疑人，根据犯罪嫌疑人去侦查犯罪事实，即“由人查事”。而公安机关侦查的案件往往是从已经明确存在的犯罪事实去侦查犯罪人，即“由事查人”。
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