国务院《医疗事故处理条例》规定，发生医疗事故的赔偿等民事责任争议，医患双方可以协商解决；不愿意协商或者协商不成的，当事人可以向卫生行政部门提出调解申请，也可以直接向人民法院提起民事诉讼。双方当事人协商解决医疗事故的赔偿等民事责任争议的，应当制作协议书。协议书应当载明双方当事人的基本情况和医疗事故的原因、双方当事人共同认定的医疗事故等级以及协商确定的赔偿数额等，并由双方当事人在协议书上签名。已确定为医疗事故的，卫生行政部门应医疗事故争议双方当事人请求，可以进行医疗事故赔偿调解。调解时，应当遵循当事人双方自愿原则，并应当依据本条例的规定计算赔偿数额。经调解，双方当事人就赔偿数额达成协议的，制作调解书，双方当事人应当履行；调解不成或者经调解达成协议后一方反悔的，卫生行政部门不再调解。关于医疗事故赔偿标准等，《医疗事故处理条例》亦有明确规定。
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解决医疗事故赔偿纠纷有请求行政调解或寻求司法救济两种途径。选择行政调解，有助于迅速解决纠纷并获得赔偿，如果无法达成协议，可以提起诉讼，能拖延赔偿纠纷的处理。
医疗纠纷的解决途径有以下四种：双方自愿协商，即医患双方自愿签署和解协议；申请人民调解即通过医疗纠纷调解委员会调解后签订调解协议解决医患纠纷；申请行政调解即通过卫健委调解追究行政责任对医疗机构行政处罚，但是需要医生违反了相关规定如果没有上述违法行为，则无法追究行政责任；向人民法院提起诉讼向当地法院提起诉讼由法院判决医患双方的责任。
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