如果你们能协商好的话最好，协商不好，起诉的话，原则上法院以有利于孩子的健康成长为标准认定抚养权： 1、如果孩子超过十岁，是要问孩子的意愿的，看孩子愿意跟谁。 2、一般情况下，看小孩从小的生活环境，平时除父母外，由谁照顾比较多；夫妻的经济状况，住房状况，等等，都会对此有影响的。例如，小孩从小由爷爷奶奶照顾，跟爷爷奶奶也比较亲，在男方所在地附近上学，为了小孩的有利成长，判的时候就可能会偏向男方。但是，如果孩子尚在哺乳期，原则上是跟女方的。 3、建议协商，因为就算起诉到法院，也是要先调解的。判决的话考虑的因素比较多，可能会比较慢。
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夫妻有两个小孩的，离婚的时候可以先协商决定孩子的抚养权归属，如果不能协商一致，可以去法院起诉，请求法院判决。法院会根据最有利于孩子的原则进行判决。
双方同意离婚两个孩子的判决：双方首先可以通过协商的方式解决俩孩子的抚养权的归属问题；协商不成的，可以就抚养权问题向法院起诉，法院一般会将不满两周岁的孩子判给母亲，让母亲抚养孩子；八周岁以上的孩子，法院会在询问过孩子的意愿的情况下，将孩子判给他愿意随之生活的一方。
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