如果单位规章有规定旷工三天属于重大违纪的，可以作开除处理。劳动合同法第三十九条【用人单位单方解除劳动合同（过失性辞退）】劳动者有下列情形之一的，用人单位可以解除劳动合同：（一）在试用期间被证明不符合录用条件的；（二）严重违反用人单位的规章制度的；（三）严重失职，营私舞弊，给用人单位造成重大损害的；（四）劳动者同时与其他用人单位建立劳动关系，对完成本单位的工作任务造成严重影响，或者经用人单位提出，拒不改正的；（五）因本法第二十六条第一款第一项规定的情形致使劳动合同无效的；（六）被依法追究刑事责任的。
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旷工三天自动离职可能会对个人今后的发展影响不太好，可能会被公司解除劳动合同，但具体的要求还是以该公司的规章制度为依据。自动离职，是职工根据企业和自身情况擅自离职，而强行解除与企业的劳动关系的一种行为。依据本企业规章制度，行使行政处分权。
员工旷工三天自动离职有工资，但是需要办理离职手续，离职时工资、押金和经济补偿是必须一次性结清的，可以扣去旷工天数。用人单位不得随意扣减。否则当事人可以去劳动局举报。
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