（1）对于“登记和公告”是专利权转让合同的生效条件还是“转让行为”的生效条件，意见不甚统一。一种观点认为登记和公告是专利权转让合同的生效条件，未经登记和公告，该转让合同为无效合同，不具有任何约束力；另一种观点则认为根据“合同自由”原则，该转让合同有效，但未经登记和公告，专利权的转让不生效，即该专利权并不发生实际的移转，合同受让方并不能成为新的专利权人。但合同对双方当事人仍有约束力，违约一方应承担违约责任。由于专利法对此规定得不明确，这两种看法均有一定的道理。但是，无论采用哪种观点都可以得出一个结论；如果不经过登记和公告，专利权不会发生真正的移转，受让方也不可能真正享有专利权。这一点，专利权转让的当事人（尤其是受让方）应特别予以注意。 （2）由于登记和公告并列成为转让生效的条件，而实践中公告又往往滞后于登记，则在当事人履行了登记手续后，在尚未公告前，仍不能发生专利权的转移。针对这两个问题，经过2000年8月25日第二次修正后的专利法规定：“转让专利申请权或者专利权的，当事人应当订立书面合同，并向国务院专利行政部门登记，由国务院专利行政部门予以公告。专利申请权或者专利权的转让自登记之日起生效”。
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专利权转让与专利申请权转让两者既有相同之处，也有本质上的区别：专利权转让中订立合同的标的是专利权，而专利申请权转让合同的标的是专利申请权；专利权转让发生在专利授权之后，转让人为专利权人，而专利申请权转让则发生在专利授权之前，转让人为专利申请人。
专利权转让合同的书写主要的内容： 1.专利名称、被许可方、许可方信息。 2.鉴于转让方同意将其拥有的专利权转让给受让方。双方一致同意签订本合同。 3.转让方式和试制。 4.资料和资料交换。 5.转让费和其他费用。 6.违约及赔偿。 7.侵权和专利失效。 8.合同生效及其他。 9.双方签字。
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