如果员工按照用人单位的离职流程依法办理离职的，老板非法克扣劳动者的工资属于违法行为，劳动者可以到用人单位所在地的劳动监察部门进行投诉，也可以到用人单位所在地的劳动争议仲裁委员会申请劳动仲裁，维护合法权益。如果劳动者自离的，劳动者因此给用人单位造成损失的，劳动者应当承担赔偿责任。《劳动合同法》第五十条用人单位应当在解除或者终止劳动合同时出具解除或者终止劳动合同的证明，并在十五日内为劳动者办理档案和社会保险关系转移手续。劳动者应当按照双方约定，办理工作交接。用人单位依照本法有关规定应当向劳动者支付经济补偿的，在办结工作交接时支付。用人单位对已经解除或者终止的劳动合同的文本，至少保存二年备查。
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公司无没有正当理由克扣工资的，可以采取以下方式来维护自身权益： 1、与公司协商。公司扣工资的，应当说明扣工资的理由，甚至所依据的相关规章制度，且相关规章制度是已经过事前公开公示，否则，公司属于无正当理由克扣工资，属于无理的违法行为，职工可以要求公司全额支付工资及相应利息损失。 2、如协商不成的，可以到当地的劳动监察大队投诉，要求协助处理解决。 3、如仍未解决的，可以至当地的劳动仲裁机构申请劳动仲裁处理解决。 4、如劳动仲裁生效后，公司拒绝执行并拒付的，可以申请法院强制执行。
公司克扣员工工资的，员工可以向劳动局申请仲裁。用人单位拖欠或者不足额支付劳动报酬的，员工可以依法申请人民法院作出支付令，要求用人单位足额支付相应的劳动报酬。用人单位应当按照劳动合同的规定，及时支付，逾期未支付的，劳动者可以向人民法院申请强制执行。
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