如果员工按照用人单位的离职流程依法办理离职的，老板非法克扣劳动者的工资属于违法行为，劳动者可以到用人单位所在地的劳动监察部门进行投诉，也可以到用人单位所在地的劳动争议仲裁委员会申请劳动仲裁，维护合法权益。如果劳动者自离的，劳动者因此给用人单位造成损失的，劳动者应当承担赔偿责任。《劳动合同法》第五十条用人单位应当在解除或者终止劳动合同时出具解除或者终止劳动合同的证明，并在十五日内为劳动者办理档案和社会保险关系转移手续。劳动者应当按照双方约定，办理工作交接。用人单位依照本法有关规定应当向劳动者支付经济补偿的，在办结工作交接时支付。用人单位对已经解除或者终止的劳动合同的文本，至少保存二年备查。
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依据我国相关法律的规定，员工犯错后公司扣除全部工资是属于违法的行为，员工犯错造成损失的，经济损失的赔偿不超过劳动者当月工资的20%。
公司员工自离有工资。只要是劳动者应得的工资，无论什么情况离职，都应当支付。劳动关系双方依法解除或终止劳动合同时，用人单位应在解除或终止劳动合同时一次付清劳动者工资。
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