自然灾害、事故灾难或者公共卫生事件发生后，市和区、县人民政府应当根据突发事件的性质、特点和危害程度，按照下列规定指挥协调应急处置工作：(一)一般突发事件发生后，由发生地区、县突发事件应急委员会指挥协调应急处置工作，根据实际需要，市专项应急指挥部协助做好相关应急处置工作;(二)较大突发事件发生后，发生地在东城区、西城区、崇文区、宣武区、朝阳区、海淀区、丰台区、石景山区的，由市专项应急指挥部指挥协调应急处置工作;发生地在其他区、县的，由发生地区、县突发事件应急委员会指挥协调应急处置工作，必要时，市专项应急指挥部协助做好相关应急处置工作;(三)重大或者特别重大突发事件发生后，由市突发事件应急委员会统一指挥应急处置工作，相关专项应急指挥部负责具体指挥和处置。前款第二项、第三项规定由市突发事件应急委员会、市专项应急指挥部指挥协调应急处置工作的突发事件，发生地区、县人民政府应当按照市总体应急预案、市专项应急预案确定的职责和要求，立即采取措施控制事态发展，组织应急救援和处置，并做好服务保障工作。突发事件发生后，需要市或者区县突发事件应急委员会、市专项应急指挥部负责人到现场指挥协调的，有关负责人应当及时赶赴现场，指挥协调应急处置工作。发生地区、县人民政府不能有效控制突发事件事态，或者不能消除突发事件引起的严重社会危害的，应当及时报请市人民政府统一领导应急处置工作;当本市不能有效控制突发事件事态，或者不能消除突发事件引起的严重社会危害时，市人民政府应当报请国务院统一领导应急处置工作。
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突发事件发生后卫生行政主管部门应当做的应急工作是： 1、突发事件发生后，卫生行政主管部门应当组织专家对突发事件进行综合评估，初步判断突发事件的类型，提出是否启动突发事件应急预案的建议。 2、国务院卫生行政主管部门或者其他有关部门指定的专业技术机构，有权进入突发事件现场进行调查、采样、技术分析和检验； 对地方突发事件的应急处理工作进行技术指导，有关单位和个人应当予以配合；任何单位和个人不得以任何理由予以拒绝。 3、对新发现的突发传染病、不明原因的群体性疾病、重大食物和职业中毒事件，国务院卫生行政主管部门应当尽快组织力量制定相关的技术标准、规范和控制措施。 4、省级以上人民政府卫生行政主管部门或者其他有关部门指定的突发事件应急处理专业技术机构，负责突发事件的技术调查、确证、处置、控制和评价工作。 5、县级以上地方人民政府卫生行政主管部门应当对突发事件现场等采取控制措施，宣传突发事件防治知识，及时对易受感染的人群和其他易受损害的人群采取应急接种、预防性投药、群体防护等措施。
应急预案和应急方案的区别包括定义不同、侧重点不同、包含性不同等。具体如下：1、定义不同。应急预案是指面对突发事件时的应急管理、指挥、救援预案等；应急措施是指在遇到突发事件时采取的应急措施。2、侧重点不同。应急预案一般应以综合防灾预案为基础，重在谋划、提前谋划；一般应在发生紧急情况时建立应急措施，重点放在处理方法和处理方法上；3、包含性不同。应急措施包含在应急计划中，是应急计划的一部分。例如，应急预案系统中的综合应急预案包括应急行动、应急措施和应急保障；在专项应急预案中，制定明确的救援程序和具体的应急救援措施；在现场处置预案中，制定具体的装置、场所或设施、岗位制定的应急处置措施。
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