土地使用税的缴纳与否，不是以纳税人使用土地为条件的，而是以是否具有使用权为条件。该私营企业应该按照实际占用的土地面积来缴纳土地使用税。《城镇土地使用税暂行条例》第二条规定："在城市、县城、建制镇、工矿区范围内使用土地的单位和个人为城土地使用税的纳税义务人。"同时该条例第三条规定："土地使用税以纳税人实际占用的土地面积为计税依据，依照规定税额计算征收。"国家税务总局《关于城镇土地使用税若干具体问题的解释和暂行规定》的通知第六条规定："纳税人实际占用的土地面积，是指由省、自治区、直辖市人民政府确定的单位组织测定的土地面积。尚未组织测量，但纳税人持有政府部门核发的土地使用证书的，以证书确认的土地面积为准；尚未核发土地使用证书的，应由纳税人据实申报土地面积。
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养殖用地一般不征收土地使用税。养殖用地实质上属于农业用地，只有城市、县城、建制镇和工矿区的国家所有、集体所有的土地，纳税人新征用的耕地，购置的新建商品房以及存量房需要缴纳土地使用税。
电厂厂区围墙内的用地征收土地使用税，电厂厂区围墙外的灰场、输灰管、输油管道、铁路专用线用地不征收土地使用税，核电站等部分用地减半征收土地使用税。
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