设立中外合资、合作经营企业经营国际船舶运输业务，应当通过拟设立企业所在地的省、自治区、直辖市人民政府交通运输主管部门向交通运输部提出申请。申请材料应当包括：(一)申请书;(二)可行性分析报告;(三)合资或者合作协议;(四)投资者的企业商业登记文件或者身份证件;(五)符合交通运输部规定的高级业务管理人员的从业资格证明。有关省、自治区、直辖市人民政府交通运输主管部门应当自收到完整齐备的材料之日起10个工作日内将申请材料及意见转报交通运输部。交通运输部应当自收到转报的上述材料和意见之日起30个工作日内，按照《海运条例》第二十九条第二款、第三款和第四款的规定以及交通运输部公布的国际海运市场竞争状况和国家关于国际海上运输业发展的政策进行审核，作出批准或者不予批准的决定。决定批准的，发给批准文件;不予批准的，应当书面通知申请人并告知理由。获得批准的申请人应当持交通运输部批准文件，按照国家有关外商投资企业的法律、法规的要求，到有关部门办理相应的设立外商投资企业的审批手续。取得相应的审批手续后，应当持有关部门许可设立企业的文件和本实施细则第五条第一款(四)至(六)项的相关材料，按照本实施细则第五条规定的程序向交通运输部领取相应的《国际船舶运输经营许可证》。
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一、外商设立登记程序 设立外商投资企业的申请经审批机关批准后，申请者应在收到批准证书之日起30日内，到登记主管机关申请办理设立登记。登记主管机关自受理申请人设立登记全部文件、证件之日起30日内，做出核准登记或不予核准登记的决定，经核准登记的，按规定收取登记费后，颁发《中华人民共和国企业法人营业执照》，并由登记主管机关发布公告。营业执照签发日期，即为外商投资企业的成立日期。 二、外商投资企业申请设立登记时，应向登记机关提交以下文件： (一)由企业正、副董事长签署的《外商投资企业申请登记表》； (二)《名称预先核准通知书》； (三)项目建议书、可行性研究报告及其批准文件； (四)合同、章程(含附件、中外文本)以及审批机关的批准文件及批准证书(副本原件一份)； (五)投资者所在国家(地区)政府出具的合法开业证明； (六)投资者的资信证明(应由同该投资者有业务往来的金融机构出具，中方投资者为全民所有制企业的，应提交国有资产管理部门出具的国有资产产权登记证明)； (七)董事会名单及董事会成员、正、副总经理的委派任职文件及上述人员的简历、身份证明； (八)企业住所使用证明； (九)登记机关要求提交的其他文件。
中外合资经营企业注册的具体程序如下：1、先检查名称并获得公司名称的预先批准通知；2、办理相关行业的预先批准；3、办理项目经过审批；4、审批后到商务部获取章程和合同批准；5、到质量监督局对组织机构代码进行预先批准并获取组织机构代码。
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