具体看是什么纠纷，如果对使用权没有异议的土地纠纷，对土地确权办证并没有影响，可以直接起诉至人民法院进行判决；如果是土地使用权的争议纠纷，则需由地方国土资源行政主管部门进行调查处决后再进行确权颁证。根据《土地权属争议调查处理办法》第十四条的规定下列案件不作为争议案件受理：（一）土地侵权案件；（二）行政区域边界争议案件；（三）土地违法案件；（四）农村土地承包经营权争议案件；（五）其他不作为土地权属争议的案件。第二十条国土资源行政主管部门在调查处理争议案件时，应当审查双方当事人提供的有关证据材料：（一）人民政府颁发的确定土地权属的凭证；（二）人民政府或者主管部门批准征收、划拨、出让或者以其他方式批准使用土地的文件；（三）争议双方当事人依法达成的书面协议；（四）人民政府或者司法机关处理争议的文件或者附图；（五）其他有关证明文件。第二十一条对当事人提供的证据材料，国土资源行政主管部门应当查证属实，方可作为认定事实的依据。第二十二条在土地所有权和使用权争议解决之前，任何一方不得改变土地利用的现状。第三十一条当事人对人民政府作出的处理决定不服的，可以依法行申请政复议或者提起行政诉讼。在规定的时间内，当事人既不申请政复议，也不提起行政诉讼，处理决定即发生法律效力。生效的处理决定是土地登记的依据。
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农民不对土地进行确权，土地的权益就不会受法律的保护，没有确权的土地会收归集体或者国家所有，当遇到房屋或者土地征收的时候，当事人的权益是得不到保障的。 土地所有权、土地使用权和他项权利的确认、确定，简称确权。是依照法律、政策的规定确定某一范围内的土地的所有权、使用权的隶属关系和他项权利的内容。 每宗地的土地权属要经过土地登记申请、地籍调查、核属审核、登记注册、颁发土地证书等土地登记程序，才能得到最后的确认和确定。 确权将理清国家与集体经济组织、集体经济组织与集体经济组织之间的财产权利界限，构建起完整的农村资产财产权益体系。
土地确权证明是土地确权成功的标志，如果没有土地确权证明，那么就没办法证明这块地是自己的。但是随着土地确权的开展，有几种情况是拿不到确权证明的：一.一户多宅的情况国家宅基地要求必须一户一宅，如果宅基地存在一户多宅的情况，那么多出来的那些是不能拿到确权证明的，不仅拿不到证明，这些宅基地还会被回收。二.改变了土地的使用性质三.非法的宅基地。进行过非法买卖获得的宅基地，这种也是不能被确权的四.有争议的宅基地。
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