根据劳动部《职工基本养老保险个人账户管理暂行办法》的规定，养老保险应该在员工的劳动关系所在地的社会保险机构办理，保险费用由用人单位缴纳，其中应当由个人承担的部分也由单位统一扣缴。由于停薪留职员工的劳动关系仍然保留在原单位，所以应该由原单位继续为其缴纳基本养老保险费。当然，停薪留职是中国改革中出现的过渡性行为，随着劳动用工制度和事业单位聘用制度的深入改革，停薪留职的现象将会逐渐消失。 职工在停薪留职期间按照什么标准缴纳养老保险的费用呢具体的标准为：停薪留职一年的，按上年度本人实际月平均工资收入缴纳基本养老保险费(其中月平均工资收入低于当年本地区的职工月平均工资60％的，按60％缴纳)。停薪留职一年以上的，原月缴费工资低于本企业职工上一年度月平均工资的，满一年后可按本企业的平均工资缴纳基本养老保险费。原缴费工资高于本企业职工平均工资的，仍按原缴费工资缴纳基本养老保险费。办理停薪留职手续的职工也可以与单位约定，由自己承担支付养老保险的全部费用，由单位代为办理相关手续。当然，经企业批准的停薪留职人员在停薪留职期限届满不愿回原单位工作的，用人单位按其自动离职办理手续，解除劳动关系。不再享受失业保险待遇，其档案由原用人单位转到其户口所在地区县劳动局。
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一、在办理停薪留职时应当有政策性的规定或与用人单位的约定，按约定执行。一般是个人按照用人单位的缴费标准全额交费。 二、如果没有用人单位的政策性规定与约定的，可以按灵活就业人员标准由本人全额交纳。
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