对
土地承包经营权进行独立征收补偿，需要有相应的程序规定来保证土地承包经营权人的补偿权利。实施征地时，征地机关应确立土地承包经营权人的受偿主体地位，就
征地补偿标准充分听取土地承包经营权人的意见，并告知征地方案及
补偿安置方案的具体内容。征地机关与土地承包经营权人达成补偿协议的，解除
土地承包合同。土地承包经营权已登记的，登记机关注销登记;未经登记的，发包人与承包人签订
解除承包合同协议。征收机关应当在拟被征收的承包地所在的村(组)、乡(镇)公告土地承包经营权征收补偿方案，土地承包经营权人在公告规定时间内，持
土地承包经营权证或土地承包经营权合同办理土地承包经营权补偿登记手续。
在土地承包经营权补偿费的支付上，宜采取征地机关直接支付给土地承包经营权人的方式，而不是由农村
集体经济组织进行分配或者让农村集体经济组织转交。因为土地承包经营权的征地补偿是国家与承包经营人之间直接的法律关系，农村集体经济组织不是这一法律关系的当事人，无权决定
土地补偿费的分配比例，而直接支付补偿费的方式也可以避免出现截留、挪用等侵害土地承包经营权人合法权益的现象。
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