一、协议离婚，协议合法有效，不存在时效的问题。只有男女
双方协议离婚后一年内就财产分割问题反悔，请求变更或者撤销
财产分割协议的，也即为撤销权的行使，这个时效为一年。对于你们的情况，这个
诉讼时效已过，是实现撤销协议的权利。
二、其实你的问题有点复杂，涉及到理论性知识比较强。我就简单就个人观点论述下吧，有些观点（例如物上请求的权的时效）在法学理论里都还存在争议的，我也不敢乱做定论，就从债权方面谈吧。
首先，如果你们的协议有效，那么你就负有转让房产的义务（因为要用来支付女儿抚养费）。
其次，如果你不肯转让房产，即违约，需要承担是违约责任，而这个责任是：你要么履行协议转让房屋的义务，要么是支付女方同等的对价。
最后，在你拒绝履行协议的义务时，女方有债权的请求权，而这个时效适用民法的一般时效
，2年。而女方这个请求权是否过时效，就要具体情况具体分析了。
三、个人认为房产登记的是你名字，你获得绝对的权利，要保住住房可以，但需要支付女方同等的对价，否则女方起诉，在请求权没过时效的情况下，胜诉后，房产存在被强行执行的可能。
四、店面，在离婚后登记为女方的名字，就属于女方的财产，除非你能证明共买的事实，例如买卖合同，发票等，都可以作为证明你出资的证据。
上诉就是离婚协议
有诉讼时效吗的回答，希望能够帮到你。
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