1.商业秘密是一个法律概念，对于具体的商业信息是否属于商业秘密的认定，同样是一个法律问题，是需要法官在审理过程中，通过证据审查，运用法律知识和审判经验据以判断和确认，因此，商业秘密的认定是法官的权力，不是其他机构和个人的职能。
2.虽然认定商业秘密是一个法律问题，但在认定过程中，涉及的却不尽是法律问题，由于商业秘密产生、运用于专业领域，往往带有大量专门性技术的事实问题，它超出了法官法律知识的范围，也不是依凭审判经验或者逻辑推理可以解决，为求得司法判断的公正和正确，于是，借助司法鉴定获得专门机构的鉴定意见便成为必要。
3.在商业秘密鉴定之前，必须对鉴材进行合法提取，才能进行商业秘密鉴定。因此在进行商业秘密鉴定时，特别要注意鉴材的提取，鉴材是怎么提取来的，来源是否合法，提取是否符合法定程序。如果鉴材不合法，或者鉴材存在混淆，必然会影响商业秘密鉴定意见。这样的商业秘密鉴定意见则不应被采信。
4.目前我国对包括商业秘密在内的知识产权
司法鉴定机构的管理“另有规定”，商业秘密的司法鉴定机构应当根据省级人民政府司法行政部门确认并公告的机构才有从事商业秘密鉴定的资格，人民法院编制的鉴定机构名册不能成为确定机构资格的依据。
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