处理房产确权纠纷的方式是：当事人可以通过和解或调解解决纠纷；当事人不愿和解、调解或和解、调解不成的，可以根据仲裁协议向仲裁机构申请仲裁；当事人没有订立仲裁协议或者仲裁协议无效的，可以向人民法院起诉；当事人对发生法律效力的判决、仲裁裁决、调解书拒不履行的，对方可以请求人民法院执行。

房产确权纠纷到法院如何处理

依据相关规定，房屋产权确权纠纷起诉的时效为三年，如果是不动产物权的权利人请求返还财产，不受诉讼时效的限制。向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。法律另有规定的，依照其规定。诉讼时效期间自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。法律另有规定的，依照其规定。但是自权利受到损害之日起超过二十年的，人民法院不予保护。有特殊情况的，人民法院可以根据权利人的申请决定延长。

《中华人民共和国仲裁法》第二条

平等主体的公民、法人和其他组织之间发生的合同纠纷和其他财产权益纠纷，可以仲裁。

《民事诉讼法》第一百二十二条

当事人起诉到人民法院的民事纠纷，适宜调解的，先行调解，但当事人拒绝调解的除外。