医疗保险、失业保险和养老保险，统称为三金，我们所说的社会保险主要是指他们。在大城市，这三金都是缴纳至当地劳动部门的社会保险管理机构，如上海是交到当地的社保中心。他们的开户、转移、关闭等都是一起操作的，无法分离，也没有理由分离。档案的转入与否应该不影响缴纳社会保险和住房公积金才是。只要双方签订了劳动合同，有原公司的退工单，有劳动证明文件（如一些城市的劳动手册），能够在当地办理录用的话，社会保险就可以缴纳了。