农村合作医疗和公司上的社会保险是冲突的，公民若已经在单位购买社会保障（包含基本医疗保险）是不可以再申请购买农村合作医疗保险的，农村合作医疗和社会保险里面的基本医疗保险不可以同时购买。

一、医保新政策交

职工基本医疗保险、新型农村合作医疗和城镇居民基本医疗保险的待遇标准按照国家规定执行。符合基本医疗保险药品目录、诊疗项目、医疗服务设施标准以及急诊、抢救的医疗费用，按照国家规定从基本医疗保险基金中支付。

二、公司交了医保还需要交居民医保吗

公司交了医保自己就不用交居民医保。

社保跟医保存在重合的话，也只能报销一次，无法重复报销，社保包含医疗保险，医保与社保的险种存在重合，社保主要有五险，分别是养老保险、医疗保险、工伤保险、失业保险、生育保险，当购买社保的时候，实际上里面已经含有了医疗保险，社会保险是一种为丧失劳动能力、暂时失去劳动岗位或因健康原因造成损失的人口提供收入或补偿的一种社会和经济制度，社会保险计划由政府举办，强制某一群体将其收入的一部分作为社会保险税形成社会保险基金，在满足一定条件的情况下，被保险人可从基金获得固定的收入或损失的补偿，是一种再分配制度，目标是保证物质及劳动力的再生产和社会的稳定。

三、怎样把合作医疗转到城市医疗保险

从2010年7月1日开始，流动人员跨省就业时可以转移自己的医保关系，个人账户可以跟随转移划转。除医保关系可跨省转移之外，随参保人身份的变化，城镇企业职工基本医疗保险，城镇居民基本医疗保险，新型农村合作医疗三种不同类型的医疗保险关系，也可互相转移。进城打工的农民工，可在就业地参加当地的职工基本医疗保险，回农村后可带回，转为新型农村合作医疗保险，而且不会中断。