犯变造金融机构经营许可证罪，处三年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处二万元以上二十万元以下罚金;情节严重的，处三年以上十年以下有期徒刑，并处五万元以上五十万元以下罚金。

单位犯该罪的，对单位判处罚金，并对其直接负责的主管人员和其他直接责任人员，依照上述规定处罚。

变造金融机构经营许可证罪是指变造商业银行、证券交易所、期货交易所、证券公司、期货经纪公司、保险公司或者其他金融机构的经营许可证的行为。

所谓金融机构经营许可证，是指中国人民银行对商业银行或者其他金融机构颁发的允许其经营金融业务的证明文件。它主要载明审批的依据、被批准经营金融业务的机构名称及审批机构等内容，它是商业银行或者其他金融机构从事经营活动的主要法律依据之一。

所谓变造，是指行为人采取剪裁、挖补、拼凑、涂改、覆盖、揭层等方法对真《经营金融业务许可证》加以改造处理，从而使其内容加以改变的行为，如变更经营单位的名称与地址、经营业务的范围、批准的日期、批准单位、批准字号等等。

一、未经批准，设立证券公司的怎么处罚

未经批准，设立证券公司的，处三年以下有期徒刑或者拘役，并处二万元以上二十万元以下罚金；情节严重的，处三年以上十年以下有期徒刑，处五万元以上五十万元以下罚金。伪造、变造、转让商业银行、证券交易所、期货交易所、证券公司、期货经纪公司、保险公司或者其他金融机构的营业执照或者批准文件的，依照规定处罚。单位犯前两罪的，对单位处以罚款，对其直接负责的主管人员和其他直接责任人员，依照规定处以罚款。