最好不要注销。在公司涉及的债权债务关系还在法院诉讼期间，若公司进行注销登记，则无法保证对该案所涉及的债权债务关系进行合理的清算和处理。债权人无法及时依法参与到债权分配中，直接导致债权人的权益难以实现。此外，由于诉讼期间公司被注销登记导致其丧失独立法人资格，即无法作为合法的诉讼主体参与到诉讼中，因此将面临诉讼主体变更问题。

法院有案件公司可以注销吗

可以的，注销营业执照跟案子无关。

注销步骤

清算公司不论是何性质的清算，均应依下列步骤展开：

1、成立清算组。

2、展开清算工作。清算组自成立之日起接管公司，开展以下业务：接管公司财产、了结公司未了业务、收取债权、清理债务、分配剩馀财产、注销公司法人资格并吊销营业执照。

3、通知债权人申报债权。

4、提出清算方案。清算组在清理公司财产、编制资产负债表和财产清单后，拟定提出清算方案，报股东会讨论通过或者主管机关确认。

清算方案的主要内容有：清算费用、应支付的职工工资和劳动保险费、应缴纳的税款、清偿公司债务、分配剩馀财产、终结清算工作。在清算进行完以后，才能进行注销。

登记

1、注销公司国、地税登记证

2、到公司主管工商局办理公司注销备案所需资料有：

公司营业执照复印件、公司股东会决议（内容就是注销公司，成立清算小组）、公司原始档案、到工商局领取表格。（这两步可同时办理）

3、登报公告（登报45日后在去注销公司）注销登报公告需要到当地市级公开发行报刊办理。

注销公告需提供的材料

1营业执照副本复印件一份，

2．公司注销股东会决议。所需资料有：公司营业执照复印件、法定代表人身分证复印件、公告内容（＊＊公司，准备注销请各债权债务人自见报45日内到我公司清算小组办理债权债务事宜）

4、登报45日后，再次到工商局办理注销申请所需资料有：公司营业执照原件（正副本）、税务注销证明文件、公司股东会决议、公司清算报告、工商局领取的表格、公司原始档案

5、到质监局注销代码证所需资料有：营业执照注销证明文件、代码证原件（正副本）至此，公司注销完毕。财产分配次序支付清算费用－》发放职工工资、社会保险费用－》清缴税款－》清还债务－》股东分配。

《最高人民法院关于适用中华人民共和国民事诉讼法的解释》第六十四条企业法人解散的，依法清算并注销前，以该企业法人为当事人；未依法清算即被注销的，以该企业法人的股东、发起人或者出资人为当事人。