5000元，注册资本印花税率是万分之五。根据《国家税务局关于资金账簿印花税问题的通知》(国税发〔1994〕25号)第一条规定，生产经营单位执行“两则”后，其“记载资金的账簿”印花税的计税依据改为“实收资本”与“资本公积”两项的合计金额。适用税率为万分之五。因此，您企业营业账簿中记载资金的账簿按“实收资本”和“资本公积”两项的合计金额的万分之五计算缴纳印花税。

一、印花税怎么计算

印花税由纳税人按规定应税的比例和定额自行购买并粘贴印花税票，即完成纳税义务。证券交易印花税，是印花税的一部分，根据书立证券交易合同的金额对卖方计征，税率为1‰。印花税根据应税凭证的性质，分别采用比例税率和定额税率两种形式。按比例税率纳税的有各种经济合同及合同性质的凭证、产权转移书据、记载资金的营业账簿。按定额税率纳税的有其他营业帐簿、权利许可证照。对于载有一个经济事项，同时适用两个以上税目税率的凭证，应按其中一个较高的税率计算纳税。

1、购销合同按购销金额万分之三贴花。纳税人为立合同人。

2、加工承揽合同按加工或承揽收入万分之五贴花。纳税人为立合同人。

3、建设工程勘察设计合同按收取费用万分之五贴花。纳税人为立合同人。

4、建筑安装工程承包合同按承包金额万分之三贴花。纳税人为立合同人。

5、财产租赁合同按租赁金额千分之一贴花。税额不足l元的按1元贴花。纳税人为立合同人。